The 2025 Nobel Prize in Chemistry Goes to Susumu Kitagawa, Richard Robson, and Omar M. Yaghi

 

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Excited to Share Our Ground-breaking Computational Work Published in 【J Am Chem Soc】! 很高興與大家分享,我們突破性的計算研究成果已發表在【美國化學會會誌】期刊!

打磨多年,寶劍終於出鞘!

這項研究早在幾年前就有了初步成果,但在其他相關工作陸續發表的同時,它只能靜靜等待。

直到某天靈光乍現,找到最合適的敘事方式——『鎖』與『螺絲』的意象,讓這個研究得以完整呈現。

很開心它終於來到最棒的舞台,和大家見面!

蛋白質就像螺絲一樣在 DNA 上「鎖合」

我們最新的研究發現,Fis 蛋白質不只是黏在 DNA 上,而是能在不同 DNA 片段之間「跳躍」,並組成像螺絲一樣互相扣緊的結構。這種動態機制,可能是細胞把小範圍的蛋白–DNA 作用,連結到大尺度染色體組織與基因表現的關鍵。

Fis 蛋白會在 DNA 片段間轉移,而不只是單純結合

DNA 溝槽+熵效應決定轉移路徑

蛋白質數量改變,就能重新塑造 DNA–蛋白複合體的樣貌

特別感謝合作夥伴 Chen Xun (南京醫科大)、Yaakov Levy (Weizmann Institute of Science)、Peter G. Wolynes (Rice University) —— 沒有團隊合作,這些成果不可能實現!

也恭喜本實驗室的碩班生承翰 (Apple) ,第一篇研究工作就發表在 JACS 上真的不簡單!

此工作發表於《美國化學會會誌》期刊 (J. Am. Chem. Soc., https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.5c09262)

恭喜本實驗室碩班生冠方與奕廷分別獲得台灣理論計算分子科學學會口說將與壁報獎

恭喜冠方(Debby) 獲得口說(Oral) 演講第二名(Second place)!


恭喜奕廷(Dylan),獲得壁報佳作獎!



MYTLab members!!

All faculty participants from Taiwan, Korea and Japan!

The Annual Meeting of the Taiwan Theoretical and Computational Molecular Sciences Association(T2CoMSA) 2025

in conjunction with the

Taiwan-Japan-Korea Trilateral Symposium 

on Computational and Theoretical Molecular Sciences 2025

August 21~22, 2025

     College of Science, National Sun-Yat senUniversity, Taiwan

Excited to Share Our Latest Computational Work Published in 【Protein Science】! 很高興與大家分享,我們最新的計算研究成果已發表在美國【蛋白質科學】期刊!

🧠 破解阿茲海默症纖維蛋白生長的祕密 🧩

我們最新的研究 〈利用分子模擬探索 Abeta42 單體在纖維蛋白表面的擴散動力學〉,揭開了阿茲海默症研究中一個長久未解的謎團——β-類澱粉蛋白(Abeta)單體在纖維蛋白表面如何移動並組裝

🔍 粗粒化分子動力學模擬的關鍵發現:
1️⃣ 方向很重要:沿纖維軸平行排列的單體擴散速度遠快於垂直排列的單體。
2️⃣ 表面質地也關鍵:平滑的纖維表面促進快速移動,粗糙的區域則會減慢擴散。
3️⃣ 隱藏的能量節奏:我們發現纖維表面存在週期性的能量地形,由其表面地形與單體物理尺寸共同塑造,像賽道上的軌道一樣引導單體的運動。
4️⃣ 纖維扭曲的調控作用:纖維固有的扭曲可選擇性地影響單體方向與擴散,進而影響纖維生長速率。

💡 為什麼重要?
這些發現將我們對纖維蛋白延伸的理解,拓展到傳統「端點延伸」模型之外。透過揭示分子方向性、表面異質性能量地形的交互作用,我們提供了全新的理論觀點,並為開發延緩或抑制病理性聚集的精準治療策略帶來啟發。

🧪 這項工作連結了分子生物物理治療策略,展現奈米尺度動態如何影響疾病進程。

🙏 特別感謝我的學生 王冠方(中正化生)、陳宏毅(中正化生)、馬元偉(清華生資) —— 你們的投入與洞察讓這項研究得以實現。看到你們在研究上的成長,讓我既欣慰又驕傲。

此工作發表於美國《蛋白質科學》期刊 (Protein Sci., https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/pro.70131)